根据国家税务总局的《货物运输业营业税征收管理试行办法》、《运费发票增值税抵扣管理办法》的规定，现制定公路、内河货物运输发票（以下简称：货物运输发票）管理的流程与实施方案。一、概述实施货物运输发票管理的基本思路是“手工采集、网络传输、电脑比对”。由于货物运输发票票量较大，各级税务机关应当积极运用信息化的手段，以方便纳税人，提高工作效率。使用信息化手段辅助管理的原则为“从实际出发，分步实施”。（一）国税局、地税局主管税务机关采集地税局主管税务机关负责《地税机关代开货物运输发票汇总清单》的录入，接收自开票纳税人报送的《自开票纳税人货物运输发票汇总清单》和代开票中介机构报送的《代开票中介货物运输发票汇总清单》。汇总货物运输发票信息，并按规定时间做好数据传递工作。国税局主管税务机关负责接收增值税一般纳税人报送的《增值税运输发票抵扣清单》的电子信息，并按规定时间做好数据上传工作。各地采集的发票信息，无论是在税务局端还是在纳税人端，其格式必须满足总局规定的接口标准。（二）数据传输1.国税局、地税局同级信息交换地方税务局根据自身网络分布和数据集中情况，在货物运输发票清单信息的汇总与传输时，可选择以下三种基本模式。一是全省无统一网络，或是有统一的网络，但是数据（包括货物运输发票清单采集的数据）采集和处理集中在区县处理，流程示意图见附图1，简称模式一；二是地市级有统一的网络，而且数据（包括货物运输发票采集的数据）采集和处理直接集中在地市级处理，流程示意图见附图2，简称模式二；三是全省（或直辖市、计划单列市）网络条件较好，而且数据（包括货物运输发票采集的数据）采集和处理直接集中在省级（或直辖市、计划单列市）处理，流程示意图见附图3，简称模式三。对于数据尚未实现集中处理的地方税务局，应积极创造条件，逐步实现数据的集中处理，确保数据传输的准确性和及时性。
2. 国家税务总局与省（自治区、直辖市、计划单列市）税务局之间的数据交换
国家税务总局与省（自治区、直辖市、计划单列市）税务局之间的数据交换，采取定期上传的方式进行。各省级税务局应在每月末将当月收集的所有货物运输发票数据通过安全的数据传输通道上传至国家税务总局。国家税务总局将对收到的数据进行汇总分析，形成全国范围内的货物运输发票数据分析报告，为政策制定提供数据支持。同时，国家税务总局将不定期对各省（自治区、直辖市、计划单列市）的数据质量进行抽查，发现问题及时反馈并督促整改，确保全国范围内数据的一致性和准确性。
3. 数据安全与保密措施
在货物运输发票管理过程中，各级税务机关必须严格遵守《中华人民共和国保守国家秘密法》及相关法律法规，确保数据的安全和保密。所有涉及数据传输的环节，均需采用加密技术，防止数据在传输过程中被非法截取或篡改。对于存储在税务机关内部的数据，应建立严格的访问控制机制，只有授权人员才能查看和操作相关数据。此外，各级税务机关还应定期组织数据安全培训，提高工作人员的数据安全意识，确保各项数据安全措施得到有效执行。
二、发票管理的具体操作流程
（一）发票开具
自开票纳税人的发票开具
自开票纳税人应按照国家税务总局的相关规定，使用符合标准的开票软件开具货物运输发票。开具发票时，应准确填写发票抬头、货物名称、数量、单价等信息，确保发票内容的真实性和完整性。发票开具完成后，自开票纳税人应及时将发票信息上传至主管税务机关指定的信息系统，以便税务机关进行数据汇总和比对。对于因特殊情况无法即时上传发票信息的情况，自开票纳税人应在规定的时间内补传，确保数据的及时性和准确性。
2. 代开票机构的发票开具
对于不具备自开票条件的纳税人，可以向主管税务机关申请由代开票机构代为开具货物运输发票。代开票机构在开具发票前，应严格审核申请人的资格和提供的资料，确保申请人具备合法的运输资质，且提供的资料真实有效。代开票机构开具发票后，应将发票信息及时录入信息系统，并将相关信息传递给主管税务机关，以便税务机关进行后续的数据处理和监管。
（二）发票抵扣
增值税一般纳税人的发票抵扣
增值税一般纳税人取得的货物运输发票，应按照国家税务总局的规定，及时录入《增值税运输发票抵扣清单》，并通过电子方式报送至主管税务机关。主管税务机关收到抵扣清单后，应将其与已有的发票信息进行比对，确认发票的真实性后，方可允许纳税人进行抵扣。对于比对结果不符的发票，主管税务机关应及时通知纳税人进行核查，并根据核查结果作出相应处理。
2. 小规模纳税人的发票抵扣
小规模纳税人取得的货物运输发票，虽然不能直接用于增值税进项税额的抵扣，但可以作为成本费用的凭证，用于企业所得税的税前扣除。因此，小规模纳税人也应妥善保管好所取得的货物运输发票，以备税务检查时使用。主管税务机关在日常监管中，应对小规模纳税人的发票管理情况进行检查，确保其依法依规使用发票。
三、监督管理与违规处理
（一）监督管理
为确保货物运输发票管理制度的有效实施，各级税务机关应加强对纳税人和代开票机构的监督管理。一方面，通过定期开展专项检查，及时发现和纠正纳税人和代开票机构在发票管理中存在的问题；另一方面，利用信息化手段，实时监控发票的开具和使用情况，对异常数据进行预警和分析，及时采取措施防范风险。同时，各级税务机关还应建立健全投诉举报机制，鼓励社会各界对发票违法行为进行监督，形成全社会共同参与的良好氛围。
（二）违规处理
对于违反货物运输发票管理制度的行为，税务机关将依据相关法律法规进行严肃处理。对于轻微违规行为，如未按规定期限上传发票信息、发票填写不规范等，税务机关将给予警告，并责令改正；对于严重违规行为，如虚开发票、伪造发票等，税务机关将依法予以罚款，情节严重的还将移送司法机关追究刑事责任。此外，对于存在违规行为的纳税人和代开票机构，税务机关还将将其纳入信用管理体系，对其未来的涉税活动进行重点监控，提高其违法成本，维护良好的税收秩序。
四、总结与展望
货物运输发票管理制度的实施，是深化税收征管改革的重要举措，对于优化营商环境、促进经济高质量发展具有重要意义。各级税务机关应深入学习了习近平新时代中国特色社会主义思想，增强“四个意识”，坚定“四个自信”，做到“两个维护”，不断提高政治站位，强化责任担当，确保货物运输发票管理制度顺利实施。同时，各级税务机关还应密切关注制度实施过程中的新情况、新问题，及时调整和完善相关政策措施，不断提升管理水平和服务质量，为建设现代化税收体系贡献力量。未来，随着信息技术的不断发展和应用，货物运输发票管理将更加智能化、精准化，为纳税人提供更加便捷高效的服务，为国家税收事业的发展注入新的活力。
